mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGTAGTAGGTTGCATAGT TATACGACCTGCTGCCTTTC AAGAAAAAAATGGGTTCCTAAGAAGAGGTAGTAGGTTGCATAGTTTTCGGGCAGGGATTTTGCCCACAAGGAGGTAACTATACGACCTGCTGCCTTTCTTAGGGCCTTATTATACCAC GCTATCAGTGAGTGAATTCTAACTGGTTTTAATTTTAAATAACCCCCCCCCCCCCCCAATATGGCCTAATTTAACAAGTTAATTAGAAGTCCATCTACTAAGTAAAAGACCAGCAAGAAAAAAATGGGTTCCTAAGAAGAGGTAGTAGGTTGCATAGTTTTCGGGCAGGGATTTTGCCCACAAGGAGGTAACTATACGACCTGCTGCCTTTCTTAGGGCCTTATTATACCACGGTAACCGGTTTCCTTGGTACCTTGCTTTGGTGTAAACACTTTTTTCTGGAGAGTTTCTCACGAATGAAAACATTGCTGGCATACCAAAGAAGCAGTGCTTGGTTTAGTGATTTATAAACAGCAGCATTATATGAACATCAACTGCTGAGAATTTAAGACTTCTGAAGTATAGTTTCTCATGTAATCTCACTTTGGGGTTGCTCAAAAGTTTGGGAAAGCATAGCTTTGTTTTTGGTCATTTTCCCTTTTCTGCTCATGACACTGCCAGCTGTAGCCCCCTTTGTAACTCTTTATCCATAAGCATTTAATGAAACTGTTGAAATACTCT 1 1 5' arm Bos_taurus mirnest let-7 9e-30 mmu-let-7d 6e-43 -45.5 ........((((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((.((((((((.....)))))).......)).)))))).)))))))))))))))))))))).))))))....... (-45.5)