mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATGCAATCTACTGTCTTTC TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CGACGGCCCTTTGGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGGGCTCTGCCCTGCTATGGGATAACTATGCAATCTACTGTCTTTCCTGAAGTGGCTGT CCAGGTTCCCTTCTGGAAGGAGGGAACATTCTAGAGCTTCTGCCTGGTGGGAAAGCCCGGGTTACCCTGATGGCAGGATCAGGCTGCTGGGGAGGGAGTGCCCCCGGTCCAGCGGGTGGAGGCGGGATCACAGGTGGCGGTGCTGTGAGATGGGGACGTGGTGGGCACTCTGGCCACTTTGGGCACAGGTTGGCCTCTGACAAACGCCAGCCTTCCTCCCAGCGCCTCCAGCACAGGTCGCCTGGGGACACCGCGGCCTCTCCGGTCTCCAGTCCAGATGGGAGCGGTCTGGTCGCCTGTGAGCCTCTCCTGAGAGCCCCGCGGGCCTCTTCGCTCCACCGGTGTCCCTGCTCCCTCTCCTCCCTCCTTCCCTCCCCTCCCTGGTCAGCGGTCTCCTCCTGCGGGGCAGCTCCCTGGGCCCACAGGCCCCTGCTGACCTGCCTGCCAGGGCCCCGGGCCCTCAGCCTCCAGCGCCACCCTGAGCTCCTGCCCCTGCCGCTCTCCGCCGCCGCCGCCTCCAGGAACCGCCTCTGGGAGCCACCAAGTCCGCCCAGTCCAGGCTCCGAGACTGACCGACGGCCCTTTGGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGGGCTCTGCCCTGCTATGGGATAACTATGCAATCTACTGTCTTTCCTGAAGTGGCTGTA 1 0 3' arm Bos_taurus mirnest let-7 2e-33 mml-let-7a-3 4e-34 -44.3 ..(((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))))))).))))))).)))))) (-44.3)