mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAAGTTTGTTTGGGGTTTC AAAACCTGAACGAACTTTGTGG CTAGTTTTCTATTGGGTTGACCAAAAAGTTTGTTTGGGGTTTCCTGTAAAATGGAGAAAAACCTGAACGAACTTTGTGGCCAACCCAATAGTACTGAA TTTTTAAGTGAAGTGGGACAACTTTCCTGGGCATTGTATTTTCAGTAGTATGTGGCTTTATATTTTTCATTAGAATTTTTAGCAGTGAATTCAAACCATGGTCTTTATAAGTATTCTGAGATTATAAAACACCCTCTTTAATATACAAACTATTTTTGTCCCCCAAATGTTTTCTTTATATATAAGAAATAGATTTTTCTATCTCCACGGGAGCATAAAACATTACCATTTTTCCCTCAATTAAATTCTGTTCTTGTACAAGAAGTGAGAAAAATTGATACTTAAATATTTAAAAAGATGAACAACCAGAGTCCTTATAAACTGTGGGCCATCACACTCTCCTTCTCAGTCCTTAAAGAGCTTCAGAGCTGAGAGAGCCGAGGCCTCAAAGGCCAAGCTGCTTGTTTACAGATGAGGAAATGGATCTAATGTGGGTTGGTGACAGGTTCAAGACCAGAAGGCTAGTTTACAGCAAAGGTAGGAAGGTAACCCCCTTTTACTAGTTTTCTATTGGGTTGACCAAAAAGTTTGTTTGGGGTTTCCTGTAAAATGGAGAAAAACCTGAACGAACTTTGTGGCCAACCCAATAGTACTGAATATTGGAAGTAAATGTCATCTACCACATGAATCTAGTTATATCAGTGAATTTCTTTTACAGCTTTGATCTGAGCATAAAAATACTTTCTAAAGATAAGGCAGGCATATTTAACCAGGGGGCCCAAATCACTCATCGAAACAGCAAAAAAGAGCTGAGGTTCTGGAGGGACCCAAGAACACAGTTCAGATTCCTTGCACTGTAACTCTCCACGCAAGTGTCTGTAGGATGTACCACTTCACGTAAGAAGCAAATGTCATATACATTCAGTACTCTGGGAATGATGGCTTCGTGGGCTGAGGATGTTTTGGAGTTAACCATTGCAGCCC 2 1 5' arm Bos_taurus mirnest 100 bta-mir-2284w 0.0003 -44.2 .((((...(((((((((((.(((.((((((((((((((.((((((((...)))).))))..)))))))))))))).))).))))))))))).)))).. (-44.2)