mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCAC GCTCATAGTTCACATCAGAGCCATATAAGGGCTAAAAGATCATTCAGACCTTCACTTAATTTGT CATGCTCATAGTTCACATCAGAGCCATATAAGGGCTAAAAGATCATTCAGACCTTCACTTAATTTGTTAAGATGAATACATCGCTTCAGCAGTAAGTCATCTGGATGGAATTGAAGTCATTCCCCTTTGATGTTCTTAACAGCTGAAACTCTTGAAAGTAACTGCTACCATCAGTGTGACGTCGAGGTATGCACTTGAGAGTCAGTTGACGGTTGCTCAGTCCGCCAATACTCTGATGAAGCCAGTGGTGAGTTTTGGGGTATAACTTGCAGCACAGACTGAGTGGTGTGATTTGTATGCATGGGTTGTTCAAATGAAATAGATTGCGGTTCACGCGAACCCCATGAATTGTTTGACAGAAGAGAGAGAGCAC 10 277 3' arm Populus_tremula pmrd 100 far-MIR529 0.0003 -102.1 ..(((((.....(((((((..((((...(((((((..((((.(((((((((.....(((((..(((....((((....))))....)))...)))))..)))))))))....(((....)))..))))...))))))).(((((((..(((((..((((....((((((.((..((...))..)))))).))))))))))))))))))..))))((((((((..((((.((((...((....)).....)))).)))).(((.....)))......)))))))))))))))(((((...((((((...(((....))).....(((((.....)))))..)))))).........))))).......))))). (-102.10)