mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGA TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTCTGCGATTTCATTGCCAGATGGCTAAACACGATTGGCTGTGAGGCAAATTATAAAAAGAAAGAGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGA 3 0 5' arm Populus_tremula pmrd MIR168 1e-56 ptc-MIR168b 7e-58 -46.3 (((.((((((((((.(((((.(..(((((..(....).(((((..((((((((......))))))))..)))))...............)))))..).))))).)))))))))).))) (-46.30)