mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTACTGAGCTGAAACACA GCTCAGTTCAGCAGGAACA TCCCTGGGCTCTGCCTCCCGTGCCTACTGAGCTGAAACACAGTTGATTTGTGCACACTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGAGTCAAGCCCCCTTG TCCCTGGGCTCTGCCTCCCGTGCCTACTGAGCTGAAACACAGTTGATTTGTGCACACTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGAGTCAAGCCCCCTTGGAGTCTGCTGTGGCCCCTGCCCTCCTTGGGTGGGCCAGTCGCTGCCCGGGGGAAGAAATGAGGACCCTGCTGGCCTGGGACCTGGGTCCGGAGGAGGAACCTGGGGATGGGTGGAGCCTGGAATGGGGTGGGTGAACCCAGCTGTTTGCTGCAGGCCCCCTCCTCCAATTTCTGCACTTGGGGACTGCCCCCGTGCCCCCCAGTCCCAACTCAAGACTGGGCTGTGCTCCCAGGGAGGATGAGCAGACAGGCAGGTGGCTGGCTGGCTGGCCTTTCCATGAAGAAAGGAAGCCAGATGTGTCCTTGCCTGGCCGACCCTCGGCCCCTCCTCGTCCCAGCTTGGTGGGGGCTTGGCTGGCCTGCATCTTCCCCGCAGCCAGTTACCAAAGAGGAAGCTGCCTTGGGCCCCCCAGACCGTTAAATGCCAACTCCGGGCTTCCGGAACCAGGCTGGCCTGAC 4 2 5' arm Bos_taurus mirnest mir-24 7e-27 bta-mir-24-2 3e-35 -33.9 .....(((((.((.((((.((.(((.(((((((((....((((((.......)).))))..))))))))).))).)).)))).)))))))..... (-33.9)