mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTGTCTCAAGCTTGCTGCC TGACAAGCTAGAGGCAGCAAC GCAAGCGGCGGTGACAAGCTAGAGGCAGCAACTGCATATCTTGCAAGAAAATTGGTTTTCAGACCATACCTATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGCCTCCCTTTGCC 3 0 3' arm Panicum_virgatum pmrd MIR444 2e-52 ssp-MIR444c 4e-47 -73 (((((.((.(((..((((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))........))))))))))))).))))))))))))))))).))))))..))).)).))))). (-73.00)