mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG GAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGGAGGAGAGTTCTCAGATAAACTCTTTCACCCAAAGTTTCCAATGGAAATTTACCCTCTAACACCAAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCACCCAACT 5 0 3' arm Phaseolus_vulgaris pmrd mir-166 0.00000000000004 pvu-MIR166a 4e-78 -51.2 ..((.((.(.((((((..((((((..((((((((((((((.((((((((........))))))))......((((((((...))))))))..))))).........)))).)))))..))))))..)))))).).)).)).... (-51.20)