mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT GGAGCTTCCCTCAGCCCATTC ATTTTTTCCATGGTCACTCTCATTACAACCTGCTAGTCCTTTTTCGTCTTTACGGTTTTCCTTTCTTTATAACTCTGCTTGCTACTCTTGCATCTCTTCAGCGCAGGAATCGATAAAAACATGCCAGAATTAGGGTTTCTGGTAGCCATGCTTTTCAGTTTTAGCTCTAAGGAAGAAGGGAAAAGGATGTACATGTGCAGAGTTCGACTACAGCTTTAGTCACATTGGGAAGGAAAGAGAGTGAAGGAGCTTCCCTCAGCCCATTCATGGATACAAAAGATTGGGTTGCAAAATTAACCACTAACTCATTCACACAATAGTATTCAGTTAGGGTGATGCTCTTTTTGCTATAATATGATTGTGTGAATGAAGTGATGCATACATATTGTGTGACCCTCTTTCTCTGAGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCTTTCTGTTGCCTCCATTTGTATTCATCTCTCAGATGGCCATGTCTAAGCTTAATCTATATATGCTTAGCACAAAAAAGGTGAGGCCATTACACTGTAGCTGATGTTACATATCGTCTTCTAGCTCTTTGTAAGTATCCACTCTCTGCCACAACTGCACAAGATTCAGCAAAAACATCTGAACAGTTGCATATGAACAGTTACATACATGCAGTAATTTGTTTAGCTTAGTCTTTTAAATGATCACTACATATCTATAAATGAATTTATGTAATTACTTTCTACACAAAGCTCTATGTCACTTC 3 0 3' arm Phaseolus_vulgaris pmrd MIR159 0.00000000001 pvu-MIR319c 0 -195.56 ........(((((......(((((......((((((((......(((((......(((((((((((((........(((.(((..((((((...........)))))).............((((((((.......))))))))............)))...)))......))))))))))))))))))....(((((((.....(((((......)))))..........((..(((((((((((((((((((.((((.(((((((.(((.....((((..((((..(.........((((...(((((((((((((.((((((((..((((.....))))..)))....))))).)))))))))))))))))..(((.......))))..))))))))))).))))..))).)))).))))))))))))........(((((.((((....(((((.....)))))...(((((((((.............)))))).)))....)))))))))..(((((..(.((((((((........))))....)))))..)))))......))))))).))....))))))).)))).)))).......(((((((((((((((((........))))..)))))....))))))))............)))))....((((((((.......))...))))))....................)))))....... (-195.56)