mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCATG TGCTATTAACTAGTGTCGCA AAAGTATCATTAGCAGCAGGCATGCTATTAACTAGTGTCGCAGGGCAACCCAAATATGTTTTTATACATATGTTTCTAGAGAACATAAGCCACAGGATGACAGAAGAGAGAGAGCATGCTATGTAGCTTATCTGATC CTAGTTCTAGATCGCGATTAATTAACTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTAACTAAAGAACAACAACTTCTTCAATTAAGATAAAAAGATAGATAGTCAAGCAAAGTATCATTAGCAGCAGGCATGCTATTAACTAGTGTCGCAGGGCAACCCAAATATGTTTTTATACATATGTTTCTAGAGAACATAAGCCACAGGATGACAGAAGAGAGAGAGCATGCTATGTAGCTTATCTGATCTGGAAATGCTTGTAGGTGGGATTTCCAGGGATAGTTATCGGAATCCTCCCGCCTTGATCAGACTGCCTACAGTGGCTTGAGCCTTCACCTTGAGACTCAGAAGTAAC 5 1 3' arm Dioscorea_alata mirnest 100 vvi-MIR156h 0.000002 -28.2 .....((((..(((.(((((((((((.((..((..(((((...(((........(((((((((...............))))))))).)))......)))))..))..))..)))))))).))).)))....)))). (-28.2)