mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCAATCCCT GGATTGTTGTCTGGCTCGGGG TCATGCTCGGATTAGGTTAGGGGGATTGTTGTCTGGCTCGGGGTCTCCGGTCGAGAATCCTTGGCCTTGCCGGAGTTGTCGTTGACCGGAGATTTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCATGCGGCATTTAG 5 0 3' arm Sorghum_bicolor pmrd mir-166 1e-53 sbi-MIR166g 4e-72 -76.2 ..((((.((.((..((((((((((((((..((((((..((..((((((((((((((.(((..(((...))))))....)).))))))))))))..))..))))))..)))))))))))))))).)))))).... (-76.20)