mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATGCTGTGCAGTTTCATC GTGGTGCATCCTCTAGTAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGAGGTGAGGTTTATTTGCTAGTTGGTCACAGGCTAACAGCATGATGGCCCAACAAATCAACGATCAGATCATGCTGTGCAGTTTCATCTGCTCGTGGATGCACAT 0 1 5' arm Sorghum_bicolor pmrd MIR167_1 8e-71 sbi-MIR167d 2e-80 -79.8 ...((((((((.(.(((((.(((((((((((((((((((((((((.((..((((....((((.((((((.....))))))))))....))))..))...)))....))))))))))))).))))))))).))))).).)))))))).. (-79.80)