mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC AGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGTCTTTATATATATTAATTACCTCTGATTTCTCCCTGACTGTTATGGATCGATGAATTCAGATATGAGGGGAAGGAAGAAAGAGGAATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCCGCTGGTGGGAGCACAT 0 1 5' arm Sorghum_bicolor pmrd MIR167_1 3e-89 sbi-MIR167e 7e-99 -77.81 ....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((.(((.......((((.((.(((((..(((((((((...((((.(((((......)))))))))...)))).)))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).. (-77.81)