mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTCCTTGGCTA CAGCCAAGGATGACTTGCCGGATATGTGCATGCATATGTTACAAGGCAGCATATGCACCCTGTTACAAGCCTGCCTGTTCTCCGGCAAGTTGTCCTTGGCTA 3 0 5' arm Sorghum_bicolor pmrd MIR169_2 6e-52 sbi-MIR169b 4e-53 -52.4 .(((((((((..((((((((((.(((.(((.((...(((.(((.((..((....)).)).))).))).)).))).)))..))))))))))..))))))))). (-52.40)