mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGAATGACTTGCCTA GGCAGGTCTTCTTGGCTAGC GATGGAGAGCCCCCTTTTGCTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCATGCCCTCTGTTGGCAATTCCTCCAGCCATGGAGATTGCACAAGGTGAATTTTTGCGGCATAGATGATGGATGCAATGTGGCTGCATGGGCAGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGTGCTCTCATCCA 0 1 5' arm Sorghum_bicolor pmrd MIR169_5 1e-91 sbi-MIR169i 6e-93 -84.8 ((((.(((((...((((.((((((((((((.((((((((((((((.(((.(((.((((((((..(((((....)))))))))).))).).))....(((((.(((.....)))..)))))...))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))).. (-84.80)