mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAAGTTCGTTTGGGTTTTT AAACCTGAACAAACATTTGGG CCAGGGAATATATTAGGTTGGCCCAAAAGTTCGTTTGGGTTTTTAGTAAGATGTTTTAGAAAAACCTGAACAAACATTTGGGCCAACCCGATATTTCTTAAA CCCCCCGACTCTGGGTGTATCTTTATACAATGATATTTACAGCACTGACCTACAGTATTAAAACATCATGAGTCGGAAATGAGAGAATCACTGCCAAGAGCAGTGGAGAATTGTTACTAGGAGACTGGGTGGAGAGTCATGTAAAGTTTATTAAGGCCACAGCTACATAATGACTCAGTTCCGTGGCACAAAACACCAGGGAATATATTAGGTTGGCCCAAAAGTTCGTTTGGGTTTTTAGTAAGATGTTTTAGAAAAACCTGAACAAACATTTGGGCCAACCCGATATTTCTTAAAGTCCTTTTCCTTGTGGCAGCAGAGGTAGATGGAAGGTTGAGAGCCAGCTTTTACTGCTCTTATCAAAGTCAAGTTACAATACAGTTCAAAAGAGACTCCTTCCTTGAGCATCTCTGTTAGAATCTCCCTATCAGGATTTCCCCAGAGCATCACCAGTCCCTGCCTTCCTCCTCTCCTCTAGATATGAGGAGGAGTCTGTGCTACAGGAACTATTATGCTGACAACCAGACCTGCGATGGAGAACTGTTGTTCAACATGACCAAGAAGATGTGCTGTTGTTCCTACAACATTGGCCGGGCCTGGAACAAGCCCTGTGAACAGTGCCCCATTCCAAGCACAGGTGGGTTTTAGTTTCGCCCTTACCAGAAAGATAACTTGGTACCTTCCCCGTGAATTGTTGGAGAA 2 0 5' arm Bos_taurus mirnest 100 bta-mir-2284h 0.00002 -43.1 ..(((((((((....((((((((((((.(((.((((((((((((..((((....)))).)))))))))))).))).))))))))))))..)))))))))... (-43.1)