mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT TCAAACTTCTCTAATTTTGATCAATGTTATACAAAAATATATTAGCATATACAATACTAAATAAAAGCATTATCAAGACATATTTCATGGTAGATGTAATGAAATAATTTGATGTTTCAGATGTTGGTGCATTTTTCTATAAACTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTGACTT 3 0 3' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR437b 4e-94 -56.4 ((((((((((((((((((((((((..(((((.((((((.(((((((((..................(((((((((.((......)).)))).)))))..(((((((......))))))).))))))))).)))))).)))))..))))))))))))))))))))))))... (-56.40)