mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT GTCAAACTTCTCTAACTTTGA AGTCAAACTTCTCTAACTTTGAAAAAAGTCTGTAGAAAAATATATTAACATCTACAATACCAAATAAATGCACTATCAAGACATATTTCATGTTGGATTTAATGAAACTAATTTGTTGTTGATCTTGGTGCACTTTTCTATAAACTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAG 1 0 3' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR437f 7e-96 -57.81 ((((((((((((((((((((((...((((.(((((((((.(.((((((.(((.((((((...............(((..(((((.....))))).)))...............)))))).))).)))))).).))))))))).))))..))))))))))))))))))))))... (-57.81)