mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT GTCAAACTCATCTAACTTTAA GTCAAACTCATCTAACTTTAAACAAGTTACTAGAAAAATGCACCAACATCTAGAATATCAAATTAGCTTCATTAAATTTTCCACGAAATGTCTTGGTAGTGTGTTTATTAAACTAGTATATGTTAATATAATTTTCTAAAAACTTGGTCAAAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAG 4 0 3' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR437m 7e-96 -41.24 ((((((((..(((((((((...((((((..(((((((.......(((((((((..((..((((..((((((....(((((....)))))....))).)))..))))..))..))))...))))).......)))))))..)))))).....)))))))))..)))))))).... (-41.24)