mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT GTAAATTCTCTCCAACTTTGA AAGTAAATTCTCTCCAACTTTGACCAAGTTTATAGAAAATACACCAACATGGCAACATCTACAAAATGAAATGAATTTCGTAAAATCTATTTTGAATATTCTTGATAGTGCAATTATTTGGTATTGCTGATGTTAGTATATTTTTCTACAAACTTGGTTAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAT 1 2 3' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR437n 1e-100 -53.6 (((((((((.((((.((((((((((((((((.(((((((((.((.((((((((((.(((......((((((....)))))).....(((((..((....))..)))))...........))).))))).))))).)).)).))))))).)))))))))))))))).))))))))).)))).. (-53.60)