mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT GTCACTTTTATAACTTTGC AAGTCACTTTTATAACTTTGCAAGGTTTTTAGAAAAATGCACCATCCTCTACAACATCAAATTAGTTTCATTAAATTCTCTATGAAATATGTCTTGGTAGTGCATTTATGTGAACCTGTAGCTGTTAATATATTTTTTATAAAAACTTAGTCAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAG 1 2 3' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR437o 2e-96 -38.41 (((((((((((.(((((((((.(((((((((....(((((((...((......((((.......(((((((..........)))))))))))...))..)))))))(((((.(((........))).))))).......))))))))).).)))))))).))))))..))))).. (-38.41)