mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAAGTTCGTTCTGGTTTTT AAACCAGAATCATCTTTTTGG TCGAGTGGGCCAAAAAGTTCGTTCTGGTTTTTAACATCTTATGGAAAAACCAGAATCATCTTTTTGGCCAACCCA ATTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTAAATATTTATTTCTTGGAAATAGTTAATTTAAAGGAGACTATTAAGTACATGCAAATACAGCTGACACGTGGGTATGACAAAGTCTTAAAGGAGGTGGGTTTTTGGAGTTTGAGAAATAGTGGAGAGGAGAAATATTATTTGAACTGTCAGTCTTGACTTCTTCATGGGTGATAAAATCAATTTGGTGAATGTTGATCAGATTTTAAAAAAAGTTTTAAAAAAGAGAGAATAGGGAAATATCTGAGTTCATTGCATGGTCTAAAATTGCTTTGAGACATTTTTGTCCCTTTTAGGTATATATGTGTTTGTATACAGGGTAACACTGTCAAATATAATTTTATTTTTTTCTTTAGTGCAGGTTGTGGGAAAAAAAAAAAAGAAGTAAGAATCATGCTGTCACTGGCAGACCTCTCTGAGTCCTTCCGGCCATTAATAGTTCATGATTGTTATCGAGTGGGCCAAAAAGTTCGTTCTGGTTTTTAACATCTTATGGAAAAACCAGAATCATCTTTTTGGCCAACCCAATACATGCCTGGTTTTCCATCAAACTCCAAATCTGAAGCACA 3 0 5' arm Bos_taurus mirnest 100 bta-mir-2284c 0.0008 -30.8 ....((.((((((((((...((((((((((((..(((...))).))))))))))))...)))))))))).))... (-30.8)