mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCAGGAGAGATGACACCGAC GGGTGTCATCTCGCCTGAAGCA GATAGGACATAGGAGGCGAGAGGGACGACGAGCCGTTGGTTTGTGGGTGTGCGTCCTATGCTCAGGAGAGATGACACCGACGTCGGACGGACCGGTCGATCCGCGCCGTGTCTGTCCGTCCGAAGTGGGTGTCATCTCGCCTGAAGCATAGGACTTACCAGCCCAGTACATCTCCCTGTTTTCA 2 1 5' arm Sorghum_bicolor pmrd 100 sbi-MIR1432 8e-102 -99.9 ....(((.(((((....((((...((.(((((((...)))))))(((((((.((((((((((((((.(((((((((((.((.(((((((((((((.((.....))))).....)))))))))).)).))))))))))).)))).)))))))))).)))..)))).))...))))))))).))). (-99.90)