mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCATTCTTTTGTCAT TTGACAGAAGATAGAGAGCACGAATAACGAGGTGCTAATTGGAACATGCACCTTAATTCTTTGTGCTCTCATTCTTTTGTCAT 3 0 5' arm Solanum_lycopersicum pmrd 100 sly-MIR156c 6e-42 -40.2 .((((((((((..(((((((((((....(((((((............))))))).....)))))))))))..)))))))))). (-40.20)