mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAT GCTTATTCTTTTTGTCCTTCCCTTTACACAAGGGAAATGAAAGTACTATTAGCTAGATACTTGA CGGCTTATTCTTTTTGTCCTTCCCTTTACACAAGGGAAATGAAAGTACTATTAGCTAGATACTTGAAGGTCACAAATAACAATTTGCTTAGAAATCCGGGAATTGACAGAAGATAGAGAGCAT 6 65 3' arm Solanum_lycopersicum pmrd 100 gma-MIR156g 0.00009 -25.6 ..((((..((((((((.(((((((((.....)))))).....((((((((.....))).)))))..))).)).......((((((.(..(....)..).))))))..))))))....)))).. (-25.60)