mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC AGAATGTCGTCTGGTTCGAGA GTTGAGGAGAATGTCGTCTGGTTCGAGATCTTTCATAAGAAAGGTAAATGAATGACAAGTTTTCATATATGTATCGTGAATGATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAC 3 0 3' arm Solanum_lycopersicum pmrd mir-166 0.000000000007 sly-MIR166a 2e-58 -51.2 (((((((.(((((..(((((((((((((((.(((((..((.(.(((.(((((.........))))).))).).))))))).)))))))))))))))..))))).))))))) (-51.20)