mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGTGCAGCGTTGATGAC CATCAACGCTAAACTCGATC CAGAGTACTTAGAAACATGATTGAGTGCAGCGTTGATGACATATTTGAGAAGTCCTGCATTTGGGCCTTCCTCATTTTTCATCAACGCTAAACTCGATCATGTTTTTAATTCTCTG 3 0 5' arm Solanum_lycopersicum pmrd MIR397 0.000006 sly-MIR397 2e-61 -56.6 (((((...((((((((((((((((((..(((((((((((...(..(((((((.(((......))).))).))))..).)))))))))))..))))))))))))))))))..))))) (-56.60)