mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAGAGTCATCTGTGACAGG TGTCGCAGATGACTCTCGATCT ATCTTCCGGTAGTCCTGTCGCAGATGACTCTCGATCTTGTCATTAAGCCCCTTTCTCTAAGTCTAATTAATTTGAATTCAATGTGGTAGGACGAGAGTCATCTGTGACAGGATTATGGAAGAT 0 1 3' arm Solanum_lycopersicum pmrd 100 sly-MIR1919a 1e-65 -61.3 ((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((..(((.......(((.....)))..........(((....))).)))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))) (-61.30)