mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAGAGTCATCTGTGACAGG TGTCGCAGATGACTTTCGCCC GCCTTTGATGTTCACATCTTCCGGTAGTCCTGTCGCAGATGACTTTCGCCCATTTATAGAACCACACTTTCTTTAATTTGAATTCTATGTGGTAGGACGAGAGTCATCTGTGACAGGATAATGGAAGATCGAGTTATCAAAGGC 1 0 3' arm Solanum_lycopersicum pmrd 100 sly-MIR1919c 4e-78 -71.9 ((((((((((.....((((((((...((((((((((((((((((((((.((.........((((((..(((........))).....)))))).)).))))))))))))))))))))))..)))))))).....)))))))))) (-71.90)