mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCAC GCTTGCTGTCTGCATA GTGCTTGCTGTCTGCATAAGGTCCAGCGTCGTGTGCCACGCACCGGGCGGCGCCACGTGGTACCGGCCACCGCCAACGCCACTGTGGGGGTGCGGGCGCCAGCTGCTGGCTGCCTGATCGGGCAGCGGGAGGGCGCAACCCGCCGCCGACGAAGAGGCAAAATGCTGGCCGGGCGCCGATGAGCGGTCCGACAAGTACTGCCACGCGAGGAGTGAGGCGCGGTTCTCGGCGATAAGGTCGTCGAGCGCCGCGCTGGAGCGCGCGGAGATGTCCGGCGTCGTGACCAGCCAGGGAGCACCGCTCGCCGCGCCGCCTCTGGCCGATGACAGAAGAGAGAGAGCAC 2 4 3' arm Saccharum_officinarum pmrd 100 zma-MIR156j 0.00002 -179.3 ((((((.((.(((((((..((.((((....(((((...))))).(((((((((...(((((...(((....)))...))))).((((((((((..(((((.....((.(((((((....))))))).))..)))))..(((...(((........))).....(((((.(((((((((....(((((.(.....).)))))..((((....((..((((((((.(((((((((...))))))))).))))))))...)).))))........))))))).)).)))))..))).))))).))))).))))))))))))))).))).))))..))...)))))) (-179.30)