mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC AGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACCGATCCATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAAGAAAGAGGGATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACAT 0 1 5' arm Saccharum_officinarum pmrd MIR167_1 4e-30 sof-MIR167a 3e-104 -84 ....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)).......(((((..(((((((((...((((...(((......)))...)))).)))))))))....))))).........))))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).. (-84.00)