mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC AGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGGTGGTATATATGAATATATGATGTCTTTACCTCTGATCTCTCCCTGACTGTCACGGATCCATGAATCCAGGATGAGGGGAGGGAAGAAAGAGGGATAATGAGCATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGGAGCACAT 0 1 5' arm Saccharum_officinarum pmrd MIR167_1 2e-32 sof-MIR167b 3e-104 -87.6 ....((((.((((.(((.(((((((((((.((((((((((((((((.((((((....)))))).)).......(((((..(((((((((...((((..((((......))))..)))).)))))))))....))))).........))))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).. (-87.60)