mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT GCCGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCCA 3 0 5' arm Saccharum_officinarum pmrd MIR168 1e-47 sof-MIR168a 2e-54 -68.8 ...((.((((((.(((.(..(((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..)))))))))))))..).))).)))))).)).. (-68.80)