mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GAGCTCCTATCATTCCAATGA GTGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGTCTACCGGAAGGGTTTGTGCAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCCATAGAAAACGAGGAGAGAGGCCTGTGGTTTGCATGACCGAGGAGCCGCTTCGATCCCTCGCTGACCGCTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCAT 5 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR159 2e-19 tae-MIR159a 1e-97 -84.3 (..((((((((.(((.(((((...((((((...((..((((.(((.((.(((.((((.(((((....((((...(((.(((((...........))))).)))...))))....))))).)))).))).))..))).))))))..)))).))..))))).))).))))))))..).. (-84.30)