mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGTGCGGTTCAATCAGA GGTATTGGTGCGGTTCAATCAGAGAGCTGGCGCCCCAGGAGGCAAGGGGTTCCTCCCTTCGATTGAGCCGTGCCAATATC 3 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR171_1 0.000000004 tae-MIR171b 4e-40 -45.6 ((((((((..((((((((((..((.(..((.(((((.........))))).))..)))..))))))))))..)))))))) (-45.60)