mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCC GAGCTCACTTCAGTCCACTC GGGAGCTCACTTCAGTCCACTCATGGGAGGTAGCGGGGATTGAACGAGCTGCCGACTCATTCACTCGAGCACACAGTAGATATGAGACTAGTCCAGGGCATACCAGTATGTTACAATATGTACTGTGCGAATGAGCGAATGCAGCGGGAGATTGTTCTCTCTTTCCTCCTCCATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC 2 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR159 0.00005 tae-MIR319 6e-109 -97.7 ((((((((.((((((((((..(((((.(((.((..((((..((((((.((.(((.(((((((.((((..(.(((((((.((((..((....))...((((((....))))))...)))).))))))).)..)))).))))).))))).)).))))))..))))..))))))))))..)))))))))).)))))))) (-97.70)