mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGAGTGAAGGGAGCTCCA GAAGCTCTGCCTTATGCTCCCG ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATCTTCCAGGGACCAGTCATGGGCCTGGAAGTAGAGAAGTTGCCATTTGAAAAGGCATGGCCGCCATCGAAGGTACCATTAATGGCCGCGTTCAACCAAGGAAATGAGATCTCAGATTCTTTCAGAACTTCTGCTTGGTTTACTTGATCCATGAAGCCATGGTTTTTTGACTCAAAGTACAGACCAGGTAAATTGCTGAAAGAAACATCTGGAAGCTCTGCCTTATGCTCCCG 2 4 5' arm Triticum_aestivum pmrd 100 gma-MIR159b 0.0002 -89.9 ...((((((((((((((((((.((((((((..(((....))).))))))))..((((...((((.........))))..((.(((((..(.(....).)..))))).))....................))))...(((((((((......((((((((((((((((..((.(((((....))))).))..)).)))))..))))))))).....))))))))).....))).)))))..)))).)))))).. (-89.90)