mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACTACATTATGGAATGGAGGGA TGGTCTTTCTGATTTTGTCTGTT GAAGCACGTGGATAGAGGAAGCACTACATTATGGAATGGAGGGAGTATGTTGTAGGCAATGATTGTTTGCCTTGAAGATTTTATAGATCCTGCTCTGGTCTTTCTGATTTTGTCTGTTCCTTTTTTTTATGTTTGGTTCG 6 2 5' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 0.0005 tae-MIR1118 9e-64 -35.1 (((.((((((((.(((((((.((..(((..((((((.((..((((((......((((((.......))))))....((((.....)))).))))))..)).)))).))..))).)))))))))..)))))))..).))). (-35.10)