mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATTCTTATATTATGAGACGGAG CCGTCCCATAATATAAGAACATTT GCGGCCGCCCGGGCAGGTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAACATTTTTGACAGTGTAGTGTCAAAAACATTCTTATATTATGAGACGGAGGGAGTATTTCCCAGCTCCTGAATCAC 3 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 8e-24 tae-MIR1120 3e-63 -63.5 .(((..((..(((.((((((((((((((((.(((((((((((((..(((((((((......)))))))))..))))))))))))).))))))))))))))))))).))..)))...... (-63.50)