mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTAGTGATCTAAACGCTCTTA AGAGTGTTTAGATCACTTAAGT TATATATGTACTCCCTCTGTAAAGAAATATTAGAGTGTTTAGATCACTTAAGTAGTGATCTAAACGCTCTTATATTTCTTTACGGAGGGAGTACTGTA 4 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 2e-27 tae-MIR1121 8e-51 -65.3 ..((((.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.....))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))) (-65.30)