mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTTCCGTTCGGAATTAC AATTCCGAACGGAGGGAGT ACATTAGATGTACTCAACTACTCCTTCCGTTCGGAATTACTCGTCCAAGAAATAAATGTATCTAAATGCATTTTAGTTGTAGATACATCCATTTTTATCATTTTTGTGACAAGTAATTCCGAACGGAGGGAGTATATTCTAATGTGGATC 0 0 5' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 1e-35 tae-MIR1127 1e-81 -63.8 ((((((((.(((......(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((...((......))..)))))))))......))))..)))))).))).))))))))))))))))))))))))))))))))))..... (-63.80)