mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTACTCCCTCCGTCCGAAA CCGGACGGAGGGAGTAATTGC ATATGAGAGCATGGGTGAGAGGTGCTTAGTTACTACTCCCTCCGTCCGAAAATACTTGTCATCAAAATGAATAAAAGGGGATGTATCTAGAACTAAAATACATCTAGATACATCCCCTTCTATCCATTTTGATGACAACTATTTCCGGACGGAGGGAGTAATTGCTTCTTCTGGCTTGGCGTTTATGT 4 0 5' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 8e-50 tae-MIR1128 8e-99 -101.9 (((((((.((.(((((.(((((.....(((...(((((((((((((((.(((((.((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((...........))))))))))))))))).))).)))))))))))))).))))).)))))))))))))))...))).))))).))))))).))))))) (-101.90)