mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTATGGAACGGAAGGAG CCCTCCGTTTCACAATGTA TACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATAGGTGTTAATGAATCTAGACATCTATATATATCTAGATTCATTAACACCTATATGAATGTGGGAAATGTTAGAATGACTTACATTATGGAACGGAAGGAGTA 2 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 9e-83 tae-MIR1132 5e-84 -108 ((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((......)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))) (-108.00)