mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTACAAAGTTGAGTCATC TGACCCAAGTTTGTACTAAA CACGATGACGACGATTACATAGCCTTGTACTCCCTCCGTTCCAAAATGGATGACCCAAGTTTGTACTAAAGTTAGTACAAAGTTGAGTCATCTATTCTGGAACGGAGGGAGTAGTAGTAATACAACGTTGCTAGTGATAAGGAAAATC 2 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR1122 3e-30 tae-MIR1137 2e-80 -71.14 ...(((.......(((((.((((..((((((((((((((((((.((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))))))))).))))))))))))))).(((....))).)))..))))))))).......))) (-71.14)