mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGTGTATAGCTCAGTTGG ATACAGAGCCGCGCCCTT CAGTACTATACCATACAGAGCCGCGCCCTTGTGATATGATAAGAAGAAAAGGGGCCAGGCCGCCCTCTTTTCTTTTCCGCAGGGTGTATAGCTCAGTTGGTAGAGCATTG 2 3 3' arm Triticum_aestivum pmrd tRNA 0.00000002 100 -43.4 ((((.((.(((((.((.((((.(((((((.(((....((...(((((((((((((......)))).)))))))))))))))))))))...)))).))))))).)).)))) (-43.40)