mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACTCCGTGGCCCAATGGA CGCATGGTCATTCAGTCAC GCTGCCACTAATCCGCATGGTCATTCAGTCACTAGTGTCTAATGGAGGAGTGAGTAAGGTTAACGTTTCATTGCATTCGCCAGGACTCCGTGGCCCAATGGATAAGGCGC 5 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd tRNA 0.0000004 100 -30.5 ((.(((....(((((...((((((..((((.((.(((..((((((((..((...........)).))))))))....))).))))))..))))))...)))))..))))) (-30.50)