mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGATGAGAAGGCAGATCATAATA TTATGATCTGCTTCTCATCTGAAG ATATTGTTGCTCAATTGTTATGATCTGCTTCTCATCTGAAGACTAGTTTATTACATATAAGCTATTCTTGGAAGTTTGAGAGAGAGATCACAAGCAGATCTTCTTCCACTTCGAGAAATATGTTTAGATATTATAAANCAGTCTTCAGATGAGAAGGCAGATCATAATAGCTGAGCAGTAATAT 0 1 3' arm Triticum_aestivum pmrd 100 100 -80.7 (((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((......(((((((((..(.(((((..(.(((..(((((.......)))))..))))))))).)..)))).)))))......))))).))))))))))))))))).)))))))))))))).))))))))))))) (-80.70)