mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTTCTCAGGTCGCCCCCGC GGGGTCGAACTGGGAACACAT TCCTGCGGGGTCGAACTGGGAACACATGGGATACGAACCGCTTGATTGAGGAGCGACTCTTATCAACTCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCCGCTGGA 2 0 3' arm Triticum_aestivum pmrd MIR398 0.0000003 tae-MIR398 1e-49 -52.5 (((.((((((.(((.((((((((((((((((((.((..(((((.......)))))..)).))))...)))))))))))))).))).)))))).))) (-52.50)