mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCCCTGACAGCCTCACT AGGGAATAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGCTAGGGATACAGAGAAAGAGAGAGATCAGAGCTAACCCTAGCTAGGTCATGCCCTGACAGCCTCACTCCTTCCTTCT 2 2 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR167_1 1e-59 vvi-MIR167d 7e-61 -46.79 ((((((..(((((.((((.(((((((((((((((((((((...(((................)))..))))))....)))))))))))))..)).)))).)))))..)))))).. (-46.79)