mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAGGATGGCTTGCCG GTTAGTCATCCTTGGCTCATT GGGGTCGAATTGAGCCAAGGATGGCTTGCCGTCATCTGCAGCAAGAGTTGGAGACTTTTAACTGTGCGTGCACGGTTAGTCATCCTTGGCTCATTTGGCCCTTCT 2 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 1e-53 vvi-MIR169b 6e-55 -61.2 ((((((((((.(((((((((((((((.((((((((.(((((.(((((((...)))))))..))))).))).))))).)))))))))))))))))))))))))... (-61.20)